La existencia de reportes ornitológicos de la zona vienen desde 1986, entre ellas podemos mencionar a Scott & Carbonell (1986), basándose en información proporcionada por Hughes de diciembre de 1982 y julio de 1984, registra 12 especies para las denominadas “Lagunas de Ite”; Morrison & Ross (1989), mencionan que la zona mantiene un moderado número de playeritos (260) y una variedad de aves de tamaño medio; Plenge (1991), registra 22 especies en los humedales y 8 especies más en las playas al norte de los humedales; Wust & Valqui (1992), durante una evaluación preliminar realizada en la Bahía de Ite reportan 74 especies, de los cuales 38 son registrados en los humedales y 11 en la zona marina; Pizarro (1995), durante el censo neotropical reporta 17 especies para las Lagunas de Ite; Høgsås (2000), durante tres evaluaciones realizadas en julio de 1996, marzo de 1997 y febrero de 1998 reporta 32, 29 y 46 especies para cada una respectivamente; Salinas (2002), reporta 22 especies para el Humedal de Ite. Adicionalmente Valqui (2004), menciona de manera general algunas especies importantes para los Humedales de Ite y Tacna.

En la actualidad se ha ido registrando e incrementando las especies de aves en el lugar, así tenemos que para el 2003 se tenía un registro de 57 especies (Chino & Vizcarra 2003), posteriormente el registro se incrementa a 72 especies (Chino 2006) y 95 especies distribuidos en los Humedales de Ite (Vizcarra 2004). Hasta hace poco se mencionaba que de las 144 especies de aves observadas en Los Humedales de Ite y alrededores, 115 fueron registradas solamente en los humedales (Vizcarra 2006); posteriormente, este registro se incremento a 126 especies de aves en los Humedales de Ite (Vizcarra 2008) (Lista Sistemática). Recientemente se han registrado 11 especies más para los humedales Dendrocygna autumnalis, Phalcoboenus megalopterus, Calidris himantopus y Tyrannus savana (Vicetti 2008); Catoptrophorus semipalmatus y Tryngites subruficollis (N. Hidalgo com. pers.); Phoenicoparrus andinus, Chloephaga melanoptera, Anas puna, Charadrius modestus y Thinocorus rumicivorus (J. K. Vizcarra obs. pers.).

En los Humedales de Ite, se ha registrado un ave típica de la orilla rocosa marina y endémica del Perú; el “Churrete Marisquero” Cinclodes taczanowskii, el cual puede observarse buscando su alimento entre los peñascos presentes en los extremos de los humedales.

De las 126 especies de aves registradas, 74 corresponden a especies acuáticas. La población de aves acuáticas, en los Humedales de Ite o Lagunas de Ite, ha ido incrementándose con el correr de los años. En 1986 se mencionaba que las Lagunas de Ite presentaban una población de más de 4 000 aves (Scott & Carbonell 1986); en la actualidad, durante los Censos Neotropicales de Aves Acuáticas, estos humedales mantuvieron una población de 27 379 aves en julio del 2004 y de 53 759 aves en julio del 2005. Estos resultados indicaban que en los Humedales de Ite se registraron la mayor concentración de aves acuáticas de todos los sitios censados a nivel nacional (Málaga 2005, Acuy & Pulido 2006).